大正10年(民國十年，1921年)四月開辦，屬基隆郡暖暖公學，五堵分教室，借民房上課。 

大正11年(民國十一年，1922年)五月升格為暖暖公學五堵分校，建教室二間。 

大正12年(民國十二年，1923年)四月升格為基隆郡五堵公學校，日人曳地新治郎任首任校長，已有教室三間。 

大正13年(民國十三年，1924年)四月原隸屬暖暖公學的友蚋分教室，改隸本校。 

昭和元年(民國十五年，1926年)三月第一屆畢業生畢業，計男生十三名，女生三名。

昭和6年(民國廿年，1931年)田中六郎擔任校長，設立七堵分教室，廿二年七堵分教室改分校。 

昭和11年(民國廿五年，1936年)渡邊綱一繼任校長，四月七堵分教室獨立，廿七年友蚋分教室獨立。

昭和16年(民國三十年，1941年)四月李金沂先生任本校校長，全台學制更改，改稱基隆郡五堵國民學校。 

民國三十四年光復後(戰後)改為台北縣立五堵國民學校，余三財先生任校長。 

民國三十五年四月余水火先生任校長。 

民國三十六年一月改隸為基隆市七堵區五堵國民學校，吳捷元先生任校長。 

民國三十七年一月籃金中先生任校長。 

民國四十年十一月余三財先生再度出任校長。 

民國四十年九月設立堵南分班，四十七年獨立。 

民國四十七年校長由侯玉格先生接任。

民國四十九年十月許振中先生接任校長。 

民國五十七年九月改名為基隆市七堵區五堵國民小學。 

民國六十年八月姜禮讓先生接任校長。 

民國六十一年八月黃耀榮先生接任校長。 

民國六十四年土地重劃後徵收校地十一筆，計一二五五平方公尺。 

民國六十七年二月楊幼卿先生接任校長。 

民國七十二年九月一日由朱崇能先生接任校長。 

民國七十三年改為仁類學校。 

民國七十四年改為智類學校。 

民國七十五年奉令為自然科學學科中心學校，基隆市自然科學教育中心。

民國七十六年七月已建專科教室十間及午餐廚房。 

民國七十八年整建運動場一座。 

民國七十九年興建教室二十間，廁所四間，升降機一座。

民國八十年學生活動中心完工。 

民國八十二年八月增資源教室。 

民國八十三年幼稚園教育廳准予立案，同年完成普通教室視聽器材設施。

民國八十三年九月附設幼稚園成立。 

民國八十三年十月附設成人夜間補校成立。 

民國八十五年二月由曾忠平先生接任校長。 

民國八十六年十一月完成私有土地徵收，增加校地0.2045公頃。 

民國八十六年十一月完成老舊宿舍拆遷補償案，學校校地漸趨完整。 

民國八十七年八月由林奇佐先生接任校長。 

民國八十七年十二月完成教室興建工程，增加教室十一間(含圖書館三間)，穿堂一間. 

民國八十八年三月興建教室完成，增加教室八間，體育器材室一間。

民國八十九年十一月一日象神颱風來襲，洪水淹沒校園，造成學校重大損失。

民國九十年八月由陳國庸先生接任校長。 

民國九十一年十二月完成教室興建工程，增加教室十二間，廁所四間。

民國九十六年八月由江漢雄先生接任校長。 

民國102年8月由黃正昆先生接任校長。